關於抑鬱癥的病因除了心理上，更有生理上的。但至今為止，抑鬱癥的根本原因和發病機制還不明確，總之是多種因素共同作用的結果。以下從生物學角度分析抑鬱癥產生的可能原因。
1、遺傳易感性
雖然沒有確切證據表明抑鬱癥具有遺傳性，但根據流行病學的臨床調查數據表明，與抑鬱癥患者的血緣關系越親近，則患抑鬱癥的概率越高。其中直系血親中的一級親屬患病幾率要遠高於旁系血親和其他親屬，一定程度上符合遺傳性疾病的遺傳規律，同時至少可以說明遺傳因素是誘發抑鬱癥的重要因素。
2、神經發育異常
神經發育異常是指大腦突觸間隙神經遞質5-羥色胺和去甲腎上腺素的濃度出現異常，被稱為中兒茶酚胺假說。如果5-羥色胺和去甲腎上腺素的濃度降低就有可能導致抑鬱癥的產生。
3、應激反應
這個是指機體會根據相應的外界環境因素刺激而做出全身性非特異性適應反應，這些反應表明患者產生了嚴重的情緒波動，大腦穩定性降低，易導致抑鬱癥發生。